9月份，全国各地气温开始下降，昼夜温差增加，这一时期，养殖水体的载鱼量、投饵量达到全年的高峰，池塘水质易恶化，容易诱发各类养殖水生动物疾病。
一、病情预测
（一）鱼类疾病
1、草鱼出血病：病原为草鱼呼肠孤病毒，主要危害草鱼鱼种，水温在20℃～30℃时易发病，25℃～28℃为流行高峰，主要传播途径是水平传播，也可能通过鱼卵进行垂直传播。各草鱼主养区需重点防控。
2、鲤浮肿病：病原为鲤浮肿病毒，主要危害鲤和锦鲤，发病水温为7℃～28℃，苗种携带病原流通是该病传播和扩散的主要途径，换水、用药不当或水质、天气突变，可诱发该病暴发。各鲤和锦鲤养殖区需重点防控。
3、淡水鱼细菌性败血症：病原主要为嗜水气单胞菌，危害鲫、团头鲂、鲢、鳙等多种淡水鱼类，水温在9℃～36℃均流行，该病可通过病鱼、病菌污染饵料、用具以及水源等途径传播，鸟类捕食病鱼也可造成疾病在不同养殖池间传播。全国各淡水养鱼地区需重点防控。
4、细菌性肠炎病：病原为肠型点状气单胞菌、豚鼠气单胞菌，主要危害草鱼、青鱼、鲤鱼等多种淡水鱼，水温20℃以上发生流行，流行高峰为水温25℃～30℃，常与细菌性烂鳃病、赤皮病等并发，是鱼类危害较严重的疾病之一。全国各淡水养鱼地区需重点防控。
5、刺激隐核虫病：俗称“白点病”或“海水小瓜虫病”，病原为刺激隐核虫，主要危害大黄鱼、卵形鲳鯵、石斑鱼等海水养殖鱼类，刺激隐核虫适宜的繁殖水温为10℃～30℃，最适繁殖水温为22℃～26℃左右，以胞囊及幼虫传播，传染速度快、具有高致病性和高暴发性，水质有机物含量高、水流缓慢、养殖密度过大情况下最易暴发。全国各海水养鱼地区需重点防控。
6、车轮虫病：病原为车轮虫，主要危害各种淡水鱼的苗种，全国各养鱼地区，一年四季都有发生，适宜水温22℃～29℃，主要症状是病鱼头部和嘴周围呈微白色，分泌很多黏液，通常鱼苗放养10天后患病，成群沿池塘边狂游，俗称“跑马病”。全国各淡水养鱼地区需重点防控。
（二）甲壳类疾病
1、白斑综合征：病原为白斑综合征病毒，主要危害对象为南美白对虾、中国对虾、日本对虾、克氏原螯虾等，水温在20℃～30℃时流行，经口感染是养殖对虾中白斑综合征病毒感染和传播的主要途径，该病毒也可经对虾的卵进行垂直传播。对虾主养区需重点防控。另外，湖北、安徽、湖南、江苏、江西等地的克氏原螯虾主养区也需要加强对该病的防控。
2、急性肝胰腺坏死病：是一种危害养殖虾类的细菌性疾病，主要危害对象为南美白对虾、斑节对虾和中国对虾等，目前我国主要海水养殖虾类地区均有该病流行，死亡主要发生在放苗30天～35天以内，常为急性死亡，而且死亡率高达100%，经口感染是该病原水平传播的主要途径。沿海对虾主养区需重点防控。
3、虾肝肠胞虫病：病原为虾肝肠胞虫，可感染所有生活阶段的对虾，主要危害南美白对虾和斑节对虾，水温24℃～31℃时感染率较高，水平传播是养殖池塘中该病原传播和感染对虾的主要途径。沿海对虾主养区需重点防控。
此外，这一时期鱼类还需注意防控柱状黄杆菌病、爱德华氏菌病、赤皮病、链球菌病、锚头鳋等疾病，甲壳类注意防控偷死、野田村病毒病、纤毛虫病、蜕壳不遂症等疾病，爬行类注意防控鳖溃烂病等疾病的危害，以及因水质恶化、天气变化等引起的非病原性疾病可能对养殖生产的影响。
二、防控措施
1、做好水质调控工作
养殖后期，投喂量增加，导致水色易变浓，从而影响水体物化指标的升高，建议使用“聚能菌素”、“安进菌霸”、“红螺壮”、“高活性芽孢杆菌”等微生态制剂调节水质，定期使用“金盾全能”、“铂盾全能”或“铂福底键”等产品改良底质，加强水环境监控，发现异常及时处理。
2、加强养殖后期生产管理
高温天气，应勤巡塘，防止发生缺氧泛塘，建议塘口常备“安进巨能氧”、“高溶氧”或“昼夜氧”，以备不时之需；及时根据气温变化调整投饵时间和投喂量，确保养殖动物营养需求及减少残饵；控制合理养殖密度，使水体负荷适度；加强养殖动物保健与应激管理，建议拌料“酶益添”、“活力肽”、“复合免疫多糖”、“免疫促长素”等营养物质，提高机体抵抗力。
3、做好台风、雷雨等突发性天气的应急准备工作
做好因突发性天气引起水环境变化的应急防范工作，同时做好减少水生动物应激反应的准备工作，在天气突变发生前后及时使用“解毒应激灵”或“复合vc应激灵”全池泼洒，提高养殖对象抗应激能力。